Journée scientifique
Journée Haute Pression STEP 2023
La Journée hautes pressions 2023 aura lieu en présentiel le jeudi 30 novembre 2023 dans l’amphithéâtre du bâtiment 20, campus Triolet.
Invité: Antonino CALIÒ, MAP (Microbiologie, Adaptation et Pathogène, INSA de Lyon et Université de Lyon,
Titre: Unravelling the mechanisms of adaptation to high pressure in proteins
Résumé:
Unravelling the mechanisms of adaptation to high pressure in proteins
Antonino CALIÒ1*, Philippe OGER1, Judith PETERS2,3,4
1Univ Lyon, UCBL, INSA Lyon, CNRS, MAP UMR 5240, 69622 Villeurbanne, France, 2Institut Laue Langevin, Grenoble, France, 3Univ Grenoble Alpes, CNRS, LiPhy, Grenoble, France, 4Institut Universitaire de France, Paris, France, *Current address: ESRF, Grenoble, France, E-Mail: antonino.calio@esrf.fr
The adaptation of proteins to high pressure is still an open debate, but understanding it could shed light on the origins of life [1], lead to a better understanding of protein dynamics, and deliver new tools to engineer pressure-resistant enzymes for biotechnological purposes. While the thermodynamic and dynamical properties of model proteins under pressure have been extensively studied [2], the evolutionary aspects of their adaptation are still unclear.
Disentangling the contributions of pressure adaptation from those of another adaptation, such as high or low temperature, is a difficult task. In fact, genomic studies could not determine a clear pattern among the order of Thermococcales.
Recent experiments by our group focused on whole cells of two closely related species (Thermococcus barophilus, Tba, and Thermococcus kodakarensis, Tko) that grow at the same optimal temperature (85°C) but differ only for the optimum pressure (400 bar for Tba, 1 bar for Tko), and they highlighted the differences in the dynamics of the two organisms’ proteomes [3]. To take this investigation to the molecular level, we studied the Phosphomannose Isomerase and the Ribosomal protein S24e from the two organisms with Elastic and Quasi-elastic Incoherent Neutron Scattering, 2-D NMR Spectroscopy, X-ray crystallography and Molecular Dynamics Simulations. Our results evidence that the substitutions of amino acids enhancing pressure stability are those in the hydrophobic core, which eliminate cavities, and those on the surface, which modulate the interaction of the proteins with the surrounding water layer and give them the right flexibility to perform their function under high pressure (fig. 1). Therefore, the study of the dynamics of these proteins enabled us to gain detailed structural information, to describe their behaviour under extreme conditions and characterize their adaptation.
Figure 1: Left, a summary of the EINS and QENS results about the effects of high pressure on Tba PMI and Tko PMI. Center and right, residue-specific difference of denaturation volume (ΔΔV) between Tba S24e and Tko S24e as measured by 2-D NMR, represented as the colour of the ribbon. Internal cavities are represented in magenta, while solvent-accessible cavities are in cyan.
References
[1] – W. Martin et al., Nature Reviews Microbiology 6, 805–814 (2008).
[2] – C. Royer, BBA – Protein Structure and Molecular Enzymology 1595, 201-209 (2002).
[3] – N. Martinez et al., Scientific Reports 6, 32816 (2016).
[4] – A. Caliò et al., International Journal of Molecular Sciences 23(15), 8469 (2022).
Journée Haute Pression STEP 2022
Modalités pratiques.
- lieu : Université de Montpellier, campus Triolet, place Eugène Bataillon, salle de séminaire du bâtiment 21, 4ième étage,
- Heure : Jeudi 24 novembre 2022 10:30 AM Paris
Programme 2022
Journée Haute Pression STEP 2021
Modalités pratiques. Distanciel
- lien zoom Journée STEP 2021
Heure : Lundi 28 juin 2021 10:00 AM Paris
Participer à la réunion Zoom
https://umontpellier-fr.zoom.us/j/87936466695
ID de réunion : 879 3646 6695
Programme 2021
Journée Haute Pression STEP 2020
Pas de journée scientifique en 2020 pour cause de COVID19
Journée Haute Pression STEP 2019
Modalités pratiques
Lieu : Université de Montpellier, Campus Triolet, Place Eugène Bataillon, bâtiment 11, 3ième étage, salle Andromède
Date : Mercredi 10 juillet
Programme 2019
Journée Haute Pression STEP 2018
pas de journée pression en 2018 car nous organisons le forum de Technologie des hautes pressions à Sète en octobre 2018.
Journée Haute Pression STEP 2017
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 31, Polytech, 1er étage, SC101
Date : jeudi 29 juin 2017
Programme 2017
Journée Haute Pression STEP 2016
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : vendredi 8 juillet 2015
Programme 2016
Journée Haute Pression STEP 2015
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : vendredi 26 juin 2015
Programme 2015
Journée Haute Pression STEP 2014
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : lundi 30 juin 2014
Programme 2014
Journée Haute Pression STEP 2013
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : lundi 1er juillet 2013
Programme 2013
Journée Haute Pression STEP 2012
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier,salle 002 à Polytech (bât 31)
Date : vendredi 29 juin 2012
Programme 2012
Journée Haute Pression STEP 2011
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : jeudi 23 juin 2011
Programme 2011
Liste de participants 2011
Journée Haute Pression STEP 2010
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle de réunion du LPTA (Andromède)
Date : mardi 22 juin 2010
Programme 2010
Liste de participants
Texte des présentations
Journée Haute Pression STEP 2009
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle de réunion du LPTA
Date : 21 janvier 2009
Programme 2009
Compte-rendu
Texte des présentations
Journée Haute Pression STEP 2021
Modalités pratiques. Distanciel
- lien zoom Journée STEP 2021
Heure : Lundi 28 juin 2021 10:00 AM Paris
Participer à la réunion Zoom
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ID de réunion : 879 3646 6695
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Journée Haute Pression STEP 2020
Pas de journée scientifique en 2020 pour cause de COVID19
Journée Haute Pression STEP 2019
Modalités pratiques
Lieu : Université de Montpellier, Campus Triolet, Place Eugène Bataillon, bâtiment 11, 3ième étage, salle Andromède
Date : Mercredi 10 juillet
Programme 2019
Journée Haute Pression STEP 2018
pas de journée pression en 2018 car nous organisons le forum de Technologie des hautes pressions à Sète en octobre 2018.
Journée Haute Pression STEP 2017
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 31, Polytech, 1er étage, SC101
Date : jeudi 29 juin 2017
Programme 2017
Journée Haute Pression STEP 2016
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : vendredi 8 juillet 2015
Programme 2016
Journée Haute Pression STEP 2015
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : vendredi 26 juin 2015
Programme 2015
Journée Haute Pression STEP 2014
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : lundi 30 juin 2014
Programme 2014
Journée Haute Pression STEP 2013
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : lundi 1er juillet 2013
Programme 2013
Journée Haute Pression STEP 2012
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier,salle 002 à Polytech (bât 31)
Date : vendredi 29 juin 2012
Programme 2012
Journée Haute Pression STEP 2011
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle Andromède
Date : jeudi 23 juin 2011
Programme 2011
Liste de participants 2011
Journée Haute Pression STEP 2010
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle de réunion du LPTA (Andromède)
Date : mardi 22 juin 2010
Programme 2010
Liste de participants
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Journée Haute Pression STEP 2009
Modalités pratiques
Lieu :Université de Montpellier, bâtiment 11, 3eétage, salle de réunion du LPTA
Date : 21 janvier 2009